Una piccola cittadina americana è luogo d'apparizione di strani tornado fluorescenti, che "rapiscono" qualsiasi cosa o persona che si trovi sul loro cammino. Tra i sopravvissuti ad uno di questi fenomeni vi sono il rude campagnolo Judd Walker, vedovo da qualche anno, e sua figlia Kelly, una studentessa della high school. Nel frattempo Gail Curter, una famosa blogger che cura un sito complottista riguardanti gli alieni, recupera sulla rete un filmato di questo strano evento e decide di recarsi sul posto per condurre in prima persona delle personali indagini, chiedendo l'aiuto di altri utenti del suo sito. In Tornado Warning i Walker e la donna si troveranno a collaborare per scoprire la reale causa dietro agli inquietanti fenomeni climatici, nel frattempo diffusi sempre più su larga scala, mentre un misterioso team di uomini in nero appartenenti ad una segreta organizzazione governativa cercano di insabbiare il tutto per evitare che si diffonda il panico nell'intero Paese.