Padre Andrew Kiernan è un prete gesuita nonché scienziato che, proprio per le sue doti di oggettività, lavora per il Vaticano come investigatore sulla veridicità o meno di presunti miracoli. Il suo ultimo incarico lo porta nel piccolo villaggio di Belo Quinto, in Brasile, dove il locale Padre Alameida, vittima di Stigmate, è recentemente passato a miglior vita e una statua della madonna ha iniziato a piangere sangue. I fatti, ritenuti di profondo interesse da Kiernan, viengono però velocemente insabbiati dalla Chiesa e l'uomo si trova ad indagare su un nuovo caso riguardante una parrucchiera di Pittsburgh, Frankie Paige, la quale ha cominciato a manifestare sul proprio corpo delle profonde ferite che ricordano per esecuzione e dinamiche quelle inferte a Gesù Cristo sulla croce. Ben presto il religioso scoprirà che la donna potrebbe cambiare per sempre le sorti del cristianesimo.