In School in the crosshairs Yuka Mitamura, studentessa al secondo anno di liceo, è la migliore alunna della sua scuola. Un giorno la ragazza mentre sta facendo ritorno a casa scopre di essere dotata di strani poteri, riuscendo ad influenzare il corso degli eventi e i pensieri delle persone. Yuka usa questo dono per fan vincere al compagno Koji, di cui è innamorata, un importante incontro di kendo; proprio quando tutto sembra andare per il meglio però la giovane riceve la visita di un inquietante individuo di origine aliena. Questo è solo il preludio all'arrivo nel suo istituto della carismatica Takamizawa la quale sembra avere un forte ascendente su gli altri studenti e i professori, al punto di essere eletta a capo delle organizzazioni scolastiche: proprio nel suo nuovo ruolo darà vita ad un elitario team di "controllori" che avrà il compito di punire gli individui più indisciplinati. Ma Yuka intuisce come dietro questa crociata per un maggior rigore vi sia ben altro...
Una giovane studentessa dotata di poteri in grando di influenzare gli eventi deve affrontare una minaccia aliena in School in the crosshairs, folle mix tra commedia e sci-fi diretto da Nobuhiko Obayashi.