In Apocalypse Earth la Terra è prossima alla fine dopo che una flotta di navicelle aliene l'ha messa a ferro e fuoco. Le fonti governative hanno preparato una gigantesca astronave sulla quale imbarcare migliaia di persone, alcune che spiccano per qualità intellettive, al fine di partire alla ricerca di un nuovo mondo. Il tenente Frank Baum, finito per pura casualità sulla nuova "arca di Noè" (ed aver involontariamente abbandonato la famiglia), si risveglia improvvisamente dalla stasi criogenica imposta a tutti i passeggeri per un guasto del mezzo, e precipita con altri membri dell'equipaggio (inclusi il capitano Sam Crowe e l'androide TIM) su un pianeta sconosciuto. Qui gli umani vengono subito attaccati da altre forze aliene, dandosi alla fuga e trovando un insperato aiuto nell'umanoide nativa Lea. Lo scopo di Baum è quello di trovare un altra navicella che possa ricondurli sul nostro Mondo.
Un gruppo di sopravvissuti alla distruzione della Terra da parte di una razza aliena giunge su un pianeta sconosciuto in Apocalypse Earth, mockbuster Asylum ricco di citazioni e "omaggi".